Организационно – методический отдел является структурным подразделением больницы. Основная цель организационно – методического отдела является  обеспечение своевременной, достоверной и качественной статистической информацией об онкологической службы Костанайской области. Отдел осуществляет свою деятельность во взаимодействии со всеми структурными подразделениями больницы и медицинскими организациями Костанайской области.
 
Возглавляет подразделение: Султанова А.К зам.гл.врача по ОМР 

Структура подразделения:
Врачи:  Сүлейменов Б.Е., Ахмедьянова Д.С., Мухаметсафина А.А.

Старшая медсестра подразделение: Байтасова Куляш Хамитовна